Персоналът на ACER включва както постоянно наети
служители, така и експерти, командировани от националните регулаторни органи
(НРО) в областта на енергетиката.
Регулаторните дейности на Агенцията се осъществяват под надзора на Съвет
на регулаторите, състоящ се от висши представители на националните регулаторни
органи в областта на енергетиката на 28-те държави членки.
Административните и бюджетните дейности на
Агенцията се осъществяват под надзора на Управителен съвет, чиито членове се
назначават от европейски институции.
И накрая, Апелативният съвет на ACER е част от
Агенцията, но е независим от нейните административни и регулаторни структури и
е натоварен с разглеждане на жалби срещу решения на ACER.